Con la nascita di Windows 95, Microsoft da il definitivo addio al software che lo ha portato ad essere la prima software house al modo.
L'MS-DOS, in realtà, cessa di esistere come prodotto stand-alone ma sopravvive nelle varie versioni di Windows 9x, ovvero fino alla Millennium Edition rilasciata nel 2000.
Windows 95 incorpora l'MS-DOS 7.0 che, sostanzialmente, aggiunge il supporto per i nomi lunghi dei file (LFN) attraverso VFAT. Di base alcune utily del vecchio MS-DOS 6.22 non vengono installate ma sono disponibili nell'edizioni CD-ROM di Windows 95 nella directory "oldmsdos". La versione 7.1 arriva nell'agosto del 1996 con Windows 95B e porta in dote il supporto al file system FAT32.
MS DOS 7.00 Command Prompt
La gloriosa storia del DOS targato Microsoft si conclude, come accennato, con Windows ME che incorpora la versione 8.0.